Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms