Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV32

Arpc1b, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1bQ9WV32 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arpc1bQ9WV32 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arpc1bQ9WV32 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arpc1bQ9WV32 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arpc1bQ9WV32 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arpc1bQ9WV32 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arpc1bQ9WV32 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Arpc1bQ9WV32 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arpc1bQ9WV32 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arpc1bQ9WV32 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arpc1bQ9WV32 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arpc1bQ9WV32 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arpc1bQ9WV32 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arpc1bQ9WV32 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arpc1bQ9WV32 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arpc1bQ9WV32 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arpc1bQ9WV32 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arpc1bQ9WV32 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms