Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnip1Q9WUU8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms