Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms