Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nrf1Q9WU00 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nrf1Q9WU00 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms