Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Skp1Q9WTX5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skp1Q9WTX5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 243.3 ms