Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms