Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W3

Rnf103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf103Q9R1W3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf103Q9R1W3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf103Q9R1W3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf103Q9R1W3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf103Q9R1W3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf103Q9R1W3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf103Q9R1W3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf103Q9R1W3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf103Q9R1W3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf103Q9R1W3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf103Q9R1W3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf103Q9R1W3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf103Q9R1W3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf103Q9R1W3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf103Q9R1W3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf103Q9R1W3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf103Q9R1W3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf103Q9R1W3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf103Q9R1W3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf103Q9R1W3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf103Q9R1W3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf103Q9R1W3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf103Q9R1W3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1016.1 ms