Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Abcc6Q9R1S7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc6Q9R1S7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms