Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms