Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubd1Q9R1K7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubd1Q9R1K7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms