Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntn3Q9R1A3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ntn3Q9R1A3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ntn3Q9R1A3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ntn3Q9R1A3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ntn3Q9R1A3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms