Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms