Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M6

Rab9a, Ras-related protein Rab-9A, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab9aQ9R0M6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab9aQ9R0M6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab9aQ9R0M6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab9aQ9R0M6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab9aQ9R0M6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab9aQ9R0M6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab9aQ9R0M6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab9aQ9R0M6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab9aQ9R0M6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab9aQ9R0M6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab9aQ9R0M6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab9aQ9R0M6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab9aQ9R0M6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab9aQ9R0M6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab9aQ9R0M6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab9aQ9R0M6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab9aQ9R0M6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rab9aQ9R0M6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rab9aQ9R0M6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rab9aQ9R0M6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab9aQ9R0M6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms