Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrpxQ9R0M3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SrpxQ9R0M3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms