Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NrkQ9R0G8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NrkQ9R0G8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
NrkQ9R0G8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms