Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Wdr54Q9R0D8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Wdr54Q9R0D8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms