Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copg1Q9QZE5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms