Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE2

Clnk, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClnkQ9QZE2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 993.2 ms