Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn8Q9QZ49 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms