Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phtf1Q9QZ09 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms