Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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