Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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