Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trip4Q9QXN3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.7 ms