Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Copg2Q9QXK3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms