Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ChmQ9QXG2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms