Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trp53inp1Q9QXE4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trp53inp1Q9QXE4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms