Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG3

Tmub1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub1Q9JMG3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmub1Q9JMG3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmub1Q9JMG3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms