Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prg4Q9JM99 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg4Q9JM99 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 694.7 ms