Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prg3Q9JL95 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms