Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx5Q9JKQ4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms