Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms