Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms