Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF4

Clec6a, C-type lectin domain family 6 member A, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec6aQ9JKF4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Clec6aQ9JKF4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec6aQ9JKF4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms