Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trem1Q9JKE2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms