Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pard6bQ9JK83 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms