Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msgn1Q9JK54 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msgn1Q9JK54 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms