Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK42

Pdk2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdk2Q9JK42 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms