Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Efcc1Q9JJF6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Efcc1Q9JJF6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms