Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad9Q9JIW5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms