Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppp1r3fQ9JIG4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms