Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

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Length 953 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Copb1Q9JIF7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Copb1Q9JIF7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms