Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2ird1Q9JI57 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms