Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RabggtaQ9JHK4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms