Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zcchc17Q9ESX4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Zcchc17Q9ESX4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms