Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESP1

Sdf2l1, Stromal cell-derived factor 2-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2l1Q9ESP1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdf2l1Q9ESP1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdf2l1Q9ESP1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms