Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim54Q9ERP3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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