Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms