Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Wdr61Q9ERF3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms