Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MesdQ9ERE7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms