Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

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Length 537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnn1Q9EQR3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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